Aisa Amagir is sinds 2003 als lerarenopleider economie verbonden aan de Hogeschool van Amsterdam in de bachelor- en masterlerarenopleiding. Sinds september 2013 is ze werkzaam als onderzoekster voor het Kenniscentrum Onderwijs en Opvoeding. Sinds september 2021 is Aisa Amagir programmaleider van het onderzoeksprogramma ‘Een onzeker bestaan in de stad ’ binnen het Kenniscentrum Ongelijkheid. In 2020 promoveerde zij aan de Universiteit van Amsterdam (UvA) op een onderzoek naar de effecten van financiële educatie op de financiële geletterdheid van leerlingen.